MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016608	CAAAT	2	10	76	85	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016608	CT	3	6	96	101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016608	GT	3	6	113	118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016608	AAG	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016608	TAT	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808758
6	NC_016608	AATTT	2	10	150	159	40 %	60 %	0 %	0 %	377808758
7	NC_016608	T	6	6	191	196	0 %	100 %	0 %	0 %	377808758
8	NC_016608	TAT	3	9	210	218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808758
9	NC_016608	AAT	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808758
10	NC_016608	GAT	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808758
11	NC_016608	ATTT	2	8	363	370	25 %	75 %	0 %	0 %	377808758
12	NC_016608	A	6	6	400	405	100 %	0 %	0 %	0 %	377808758
13	NC_016608	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808758
14	NC_016608	ATCA	2	8	437	444	50 %	25 %	0 %	25 %	377808758
15	NC_016608	AAGAAA	2	12	458	469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	377808758
16	NC_016608	TAA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808758
17	NC_016608	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	377808758
18	NC_016608	TA	3	6	717	722	50 %	50 %	0 %	0 %	377808758
19	NC_016608	TAA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808758
20	NC_016608	CAG	2	6	798	803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808758
21	NC_016608	AAAAC	2	10	811	820	80 %	0 %	0 %	20 %	377808758
22	NC_016608	CTT	2	6	847	852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377808758
23	NC_016608	TGA	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808758
24	NC_016608	CAA	2	6	932	937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808758
25	NC_016608	GCG	2	6	940	945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808758
26	NC_016608	TGA	3	9	1021	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808758
27	NC_016608	ACT	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808758
28	NC_016608	TGG	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808758
29	NC_016608	GAA	3	9	1199	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808758
30	NC_016608	TAC	2	6	1238	1243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808758
31	NC_016608	AGA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016608	GTA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016608	GTA	3	9	1475	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016608	GAT	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808759
35	NC_016608	TTG	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808759
36	NC_016608	GAA	3	9	1674	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808759
37	NC_016608	TCG	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016608	AAG	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016608	CAA	2	6	1930	1935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016608	TAT	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016608	GAA	2	6	1971	1976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808760
42	NC_016608	TAAG	2	8	2051	2058	50 %	25 %	25 %	0 %	377808760
43	NC_016608	AAAAT	2	10	2066	2075	80 %	20 %	0 %	0 %	377808760
44	NC_016608	AGA	2	6	2107	2112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808760
45	NC_016608	AAAG	2	8	2161	2168	75 %	0 %	25 %	0 %	377808760
46	NC_016608	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	377808760
47	NC_016608	TTA	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808760
48	NC_016608	T	6	6	2292	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	377808761
49	NC_016608	TTC	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377808761
50	NC_016608	TTA	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808761
51	NC_016608	TAA	2	6	2396	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808761
52	NC_016608	T	6	6	2497	2502	0 %	100 %	0 %	0 %	377808761
53	NC_016608	TGC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808761
54	NC_016608	TGA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808762
55	NC_016608	GTT	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808762
56	NC_016608	T	7	7	2710	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	377808762
57	NC_016608	T	6	6	2726	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	377808762
58	NC_016608	CTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377808762
59	NC_016608	ATC	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016608	AAGTTA	2	12	2889	2900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016608	AGA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016608	TGA	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016608	ACA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016608	AAAG	2	8	3033	3040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016608	TGAC	2	8	3045	3052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016608	GTG	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808763
67	NC_016608	ATT	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808763
68	NC_016608	AAG	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808763
69	NC_016608	AAAG	2	8	3271	3278	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
70	NC_016608	AGAA	2	8	3351	3358	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
71	NC_016608	ACC	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808763
72	NC_016608	TAA	2	6	3538	3543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808763
73	NC_016608	TGGT	2	8	3584	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	377808763
74	NC_016608	A	6	6	3602	3607	100 %	0 %	0 %	0 %	377808763
75	NC_016608	A	6	6	3609	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	377808763
76	NC_016608	GGC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808763
77	NC_016608	A	7	7	3666	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	377808763
78	NC_016608	GAG	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377808763
79	NC_016608	GAT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
80	NC_016608	GAAA	2	8	3764	3771	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
81	NC_016608	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808763
82	NC_016608	GAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
83	NC_016608	GCG	2	6	3961	3966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808763
84	NC_016608	TTAA	2	8	3995	4002	50 %	50 %	0 %	0 %	377808763
85	NC_016608	ATT	2	6	4033	4038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808763
86	NC_016608	CAA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808763
87	NC_016608	CTCA	2	8	4060	4067	25 %	25 %	0 %	50 %	377808763
88	NC_016608	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	377808763
89	NC_016608	TAAA	2	8	4086	4093	75 %	25 %	0 %	0 %	377808763
90	NC_016608	A	6	6	4112	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	377808763
91	NC_016608	AATT	2	8	4167	4174	50 %	50 %	0 %	0 %	377808763
92	NC_016608	AACA	2	8	4191	4198	75 %	0 %	0 %	25 %	377808763
93	NC_016608	AACG	2	8	4220	4227	50 %	0 %	25 %	25 %	377808763
94	NC_016608	TGA	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
95	NC_016608	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808763
96	NC_016608	CAA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808763
97	NC_016608	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808763
98	NC_016608	CAA	2	6	4313	4318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808763
99	NC_016608	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
100	NC_016608	ATG	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
101	NC_016608	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808763
102	NC_016608	AGC	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808763
103	NC_016608	GCAA	2	8	4642	4649	50 %	0 %	25 %	25 %	377808763
104	NC_016608	CCA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808763
105	NC_016608	TTAT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	377808763
106	NC_016608	AGCTT	2	10	4710	4719	20 %	40 %	20 %	20 %	377808763
107	NC_016608	ATC	2	6	4734	4739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808763
108	NC_016608	ATG	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
109	NC_016608	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	377808763
110	NC_016608	CGA	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808763
111	NC_016608	CAA	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808763
112	NC_016608	GAC	2	6	4868	4873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808763
113	NC_016608	AGAAA	2	10	4880	4889	80 %	0 %	20 %	0 %	377808763
114	NC_016608	TGA	2	6	4990	4995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808763
115	NC_016608	TAA	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016608	CTAAA	2	10	5158	5167	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016608	AAAG	2	8	5176	5183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016608	CAAA	3	12	5200	5211	75 %	0 %	0 %	25 %	377808764
119	NC_016608	CAAG	2	8	5229	5236	50 %	0 %	25 %	25 %	377808764
120	NC_016608	AGA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808764
121	NC_016608	GAA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808764
122	NC_016608	TGA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808764
123	NC_016608	AAG	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808764
124	NC_016608	A	7	7	5378	5384	100 %	0 %	0 %	0 %	377808764
125	NC_016608	CAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808764
126	NC_016608	TAA	2	6	5461	5466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808764
127	NC_016608	GATT	2	8	5515	5522	25 %	50 %	25 %	0 %	377808764
128	NC_016608	AGG	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016608	GACC	2	8	5727	5734	25 %	0 %	25 %	50 %	377808765
130	NC_016608	AGT	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808765
131	NC_016608	TCA	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808765
132	NC_016608	GTGA	2	8	5803	5810	25 %	25 %	50 %	0 %	377808765
133	NC_016608	GAAAT	2	10	5840	5849	60 %	20 %	20 %	0 %	377808765
134	NC_016608	T	6	6	5854	5859	0 %	100 %	0 %	0 %	377808765
135	NC_016608	AGA	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808765
136	NC_016608	GCAG	2	8	6099	6106	25 %	0 %	50 %	25 %	377808765
137	NC_016608	AGA	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808765
138	NC_016608	AGGA	2	8	6139	6146	50 %	0 %	50 %	0 %	377808765
139	NC_016608	ACT	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808766
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